部分地区禽戊型肝炎病毒分子流行病学分析

文章来源:肝病_肝病治疗_肝病治疗最好的医院   发布时间:2021-8-12 11:31:24   点击数:
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禽戊型肝炎病毒(avainhepatitisEvirus,aHEV)属于肝炎病毒科正戊肝病毒属B种,是一种无囊膜的单股正链RNA病毒,主要流行4个基因型:澳大利亚和韩国的基因1型,美国的基因2型,中国和欧洲的基因3型,匈牙利和中国台湾的基因4型。

该病原引起的疾病最早可追溯到20世纪80年代澳大利亚、美国、加拿大等陆续报道的鸡大肝大脾病(bigliverandspleendisease,BLS)或肝炎脾大综合征(hepatitis-splenomegaly,HS),年确定病原并命名为禽戊型肝炎。

年我国就有BLS抗体阳性的报告,年和年分别从肉种鸡和蛋鸡群中分离到aHEV。aHEV多感染产蛋期鸡群,病程为1~2个月甚至更长,临床主要表现为死淘率升高(5%~15%)。

剖检可见,肝脾肿大、出血,卵泡萎缩变形等,后期易继发细菌感染。为分析我国aHEV基因变异情况,对年从山东、河南、河北、辽宁、吉林、黑龙江、陕西、山西、江苏等地疑似感染aHEV鸡群中采集的肝脏、脾脏病料样品进行aHEVRT-PCR检测,并对aHEV阳性产物进行ORF1基因序列测定与遗传进化分析。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 病料 

年采集山东、河南、河北、辽宁、吉林、黑龙江、陕西、山西、江苏9个省份疑似aHEV感染的鸡肝脏、脾脏样品共计份,无菌处理后,置于-20℃保存备用。

1.1.2 试剂

RNAout提取试剂盒,购自天恩泽生物公司;HiScript?IIOneStepRT-PCRKit,购自诺唯赞生物公司;DLDNAMarker,购于宝生物工程(大连)有限公司。

1.2 方法

1.2.1 引物设计 参照GenBank已公布的aHEV-ORF1基因核苷酸序列,利用Oligo6.0软件设计扩增aHEV-ORF1基因的特异性引物(aHEV-ORF1-F:5-FCGTCTCGCAGATAGCAGAGTCC-3;aHEV-

ORF1-R:5-TATAGCCCATTCCCGCTCAATC-3)。

引物由北京华大基因科技有限公司合成,预期扩增目的片段为bp。

1.2.2 病毒核酸提取 组织RNA和DNA提取,按核酸提取试剂盒和核酸提取仪说明书进行操作。

1.2.3 核酸扩增 用RT-PCR一步法试剂盒扩增cDNA:45℃反转录30min;94℃预变性3min,94℃变性40s,53℃退火30s,72℃延伸1min,共30个循环;72℃再延伸10min,4℃保存10min。

PCR产物用1.0%琼脂糖凝胶进行电泳,置于凝胶成像系统中观察结果。

1.2.4 ORF1基因序列分析 挑取阳性样品产物送上海生工生物工程技术服务有限公司进行测序。用MegAlign和Mega6.0软件,对测定的aHEV-ORF1基因序列与GenBank中部分代表性毒株序列进行同源性比较和遗传进化分析。

2 结果

2.1 RT-PCR检测

对送检的份样品处理后进行RT-PCR检测,其中37份样品扩增出bp左右的目的片段(图1),为aHEV阳性。将测序结果与GenBank比对,结果均为aHEV。

2.2 ORF1基因同源性分析从不同地区RT-PCR阳性样品中,随机选取15个试验毒株ORF1核苷酸序列,利用MegAlign进行同源性比较。结果(图2)显示:试验株之间ORF1基因同源性为90.1%~%,而与基因1型的澳大利亚株和韩国株同源性为85.5%~89.0%,与基因2型的美国原型株和美国无毒株同源性为85.5%~88.2%,与基因3型的欧洲株和中国株同源性为86.3%~89.7%,与基因4型的匈牙利株和中国台湾株同源性为86.4%~88.5%。

2.3 ORF1基因遗传进化分析

利用Mega6.0对15株试验株的ORF1基因进行序列比较,绘制遗传进化树。结果(图3)显示:15株aHEV均属于戊型肝炎B种,形成独立的基因分支,但不属于已报道的4个基因型(基因1~4型)。

3 讨论

目前国内外都对aHEV进行了血清学和分子流行病学调查研究。我国南方鸡群aHEV血清阳性率约为33%,广东、山东、黑龙江3个省份的鸡群血清阳性率约为28.3%。这些血清学调查结果均显示,aHEV已在我国鸡群中广泛流行。但血清学调查只能反映鸡群的抗体水平,无法检测鸡群的病原感染情况,且病毒分离难度较大;而分子生物学方法操作简单、结果直观、敏感性高、特异性强、重复性好,已被广泛应用于临床检测。

ORF1基因编码aHEV的多聚蛋白,包含甲基转移化酶、解螺旋酶以及RNA依赖的RNA聚合酶。它们是目前国内外aHEV的主要分型依据。

本研究通过RT-PCR方法,对年山东、河南、河北、辽宁、吉林、黑龙江、陕西、山西、江苏等地区疑似aHEV感染鸡群的份肝脏和脾脏病料样品进行aHEV检测,结果检出37份阳性样品,阳性检出率为5.45%,说明我国鸡群存在不同程度的aHEV感染,这应引起养鸡企业的高度重视。

通过对15株aHEV野毒株的ORF1基因进行测序分析,发现所检出毒株均属于B种,但不属于现已报道的4个基因型,为新亚型。通过核苷M.DLDNAMarker;酸同源性比对分析发现,15株aHEV野毒株与基因1~4型的代表株同源性均低于90%,而15株分离株之间的差异不大,同源性为90.1~%。目前关于aHEV新亚型的相关报道较少,本研究为我国aHEV的分子流行病学分析提供了补充和参考。

免责申明:本文所发资料信息来自鸡保姆整理。作者:张 翔,林婷婷,刘丰波,宋姗姗,李 彬,栾栋祖,王群,刘 平,刘红祥,马 冬,任衍倍,刘 东。

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